Setelah pembantaian keluarganya yang kejam oleh tentara bayaran dingin Sub-Zero, Hanzo Hasashi diasingkan ke Netherrealm yang menyiksa. Di sana, sebagai imbalan atas pengabdiannya kepada Quan Chi yang jahat, dia diberi kesempatan untuk membalaskan dendam keluarganya – dan dibangkitkan sebagai Scorpion, jiwa tersesat yang bertekad untuk membalas dendam. Kembali ke Earthrealm, Lord Raiden mengumpulkan tim prajurit elit – biksu Shaolin Liu Kang, perwira Pasukan Khusus Sonya Blade dan bintang aksi Johnny Cage – sekelompok pahlawan yang tidak terduga dengan satu kesempatan untuk menyelamatkan umat manusia. Untuk melakukan ini, mereka harus mengalahkan gerombolan gladiator Dunia Luar Shang Tsung dan menguasai turnamen Mortal Kombat.
