Sekelompok ninja misterius membuat serangan mendadak di Konohagakure, yang menimbulkan kerusakan besar. Mimpi buruk Perang Dunia Shinobi yang lain bisa menjadi kenyataan. Sasuke, yang masih merupakan ninja pelarian dari Konoha mencoba membunuh saudaranya, Itachi, muncul untuk kedua kalinya di depan Naruto di lokasi yang tidak diketahui untuk mencegah hal itu terjadi.
